Western blot及CoIP实验步骤

2020-11-08

Western-Blot&Co-iP

步骤:

(一)提蛋白

1.       胞培养基,用1x PBS(建议经过过滤)清洗两次

2.       将细胞培养放在冰上,加入含有抑制剂的裂解液RIPA Buffer4˚C冰箱中20min~30min

细胞皿规格

6well

60mm

100mm

裂解液用量

120µl

300µl

800µl


3.       收集裂解液在一个新的1.5ml EP管中,4˚C下以15000rpm离心15min~30min


()WB

4.       取出适量的蛋白样品(上清),加入loading buffer(将6xloading配比成1x,即5体积的白裂解液+1体积的6x loading buffer),95˚C(或100˚C)金属浴5min

a)                      上清收集离心后,可直接冻存在-20˚等到要上样的时候,加入loading buffer。进行蛋白变性。

b)                      6x loading buffer从冰箱中取出后需要先进行预热至液体不再黏稠(可以在金属浴旋转放置20sec

5.       金属浴结束后,样本短暂置于冰上冷却后。用小型离心机离心,将液体管壁上的液体集中在管底

6.       1x running buffer进行电泳(一个孔最大上样量是20µl

预制胶类型

10%浓缩胶

(金斯瑞)

4%20%梯度胶(金斯瑞)

4%20%梯度胶(美伦)

4%20%梯度胶(美伦)

电压

140V

190V

170V

110V

时间

1h

40min

30min

65min

a)                      金斯瑞的预制胶底部有封条,需要使用前撕开。美伦的胶需要先在室温静置510min拔梳子要在液体环境下均匀用力缓慢拔出,确保没有胶残留在孔里面

b)                      电泳电压不宜过快,如若过快会导致蛋白样本模糊以及有拖带

c)                      上样量不能过多,否则蛋白条带会不够锐利。(推荐量1l);

d)                      上样时尽量将样品在加在电泳胶的正中间,空白孔使用等量的1xloading填上;

e)                      确保样品之间的盐浓度是平衡的,确保蛋白泳道不会歪。

7.       转膜(湿转)

黑胶白膜:注意不要有气泡,用转膜液110v100min,置于冰上。黑板对黑面,白板对红面。

a)                      转膜液安装好三明治黑板-黑网-滤纸-胶-膜-滤纸-黑网-白板,这样可以排除气泡。

b)                      湿转的电泳槽埋在冰下以后,加入约1/4的脸盆的水。确保电泳槽被冰水混合物接触。

c)                      装膜前可选操作是:将蛋白胶在转膜液浸泡510min洗去电泳液。

d)                      转膜液可回收,但必须经过过滤,除去液体中的固态残留物。避免影响下次实验。

8.       封闭:用含有5%的牛奶或者25%BSA in 1x TBST封闭,室温摇床1h1.5h

a)                      部分抗体对封闭的液体是有要求的。注意先看抗体说明书。如果是磷酸化Tyr的抗体绝对不能使用脱脂牛奶封闭。

b)                      封闭液中含有蛋白,所以现配现用。

c)                      在荧光蛋白质印迹实验中,Tris 盐缓冲液 (TBS) 用作封闭缓冲液稀释剂。封闭缓冲液中不得有 Tween 20® 去垢剂,因为它能自发荧光并增加非特异性背景。封闭步骤后,随后的稀释剂缓冲液再添加 Tween20® 。化学发光蛋白质印迹实验在封闭期间无需省去 Tween 20®

d)                      封闭结束可以用1XTBST清洗有粘性的牛奶封闭液

9.       抗孵育:4˚C下摇床过夜孵育,或在室温下摇床孵育2小时;

a)                      部分抗体含有HRP的基团可以直接省略后续的步骤1011

10.       清洗1:室温下1x TBST清洗三次每次5min

11.       二抗孵育:在室温下摇床孵育2小时;

12.       清洗2:室温下用1x TBST清洗三次,每次5min

13.       显影显影液1:1配制,(室温避光放置5h没问题)





溶液配制:

1.       NaCl (MW: 58.44)

4M 50ml 11.688g

2.       Tris [tris base] (MW: 121.14)

1M 50ml 6.057g

3.       NP40裂解液:

Tris 50mM 

NaCl 200mM

NP40 1%

4.       裂解液(现配现用):

RIPA或者np-40(store)1ml

磷酸酶抑制剂A10ul

磷酸酶抑制剂B10ul

蛋白酶抑制剂P10ul

5.       1x电泳液现配现用美伦有自己的10x buffer,一次电泳大约需要800ml

金斯瑞:为配制好的粉末融于1L的蒸馏水中

美伦生物:使用10x的液体,稀释到1L的蒸馏水中

6.       10x转膜液配方(常温保存):

Tris                30.3g

甘氨酸        151.1g

蒸馏水        up to 1L

7.       1x 转膜液(可重复使用,4度保存必须每次过滤,溶液变绿后丢弃

10x转膜液

100ml

20ml

甲醇

200ml

40ml

ddH2O

Up to 1L

Up to 200ml

8.       10x TBS



终浓度

MW

Tris Base

24.2g

200mM

121.14

NaCl

80g

1.37M

58.44

ddH2O

Up to 1L

pH=7.6


注意:可能需要15ml的浓盐酸调节pH值。浓盐酸13稀释在dH2O中,注意浓盐酸稀释会释放大量的热量,且对乳胶手套有一定的腐蚀性。在通风橱中小心操作。

9.       1x TBST

10x TBS

100ml

Tween-20

1ml

ddH2O

Up to 1L

10.       抗体配制

配制一抗,1:1000,可以回收利用,保存于-20冰箱。(一抗专门的抗稀释液,也可以用含有5% BSA5%牛奶的TBST稀释,也可以TBST 直接稀释)

二抗配制1:2000,可以回收利用,保存在-20°。(可以用含有5% BSA5%牛奶的TBST稀释,也可以TBST 直接稀释









磁珠富集蛋白(适用于CO-IP

1.       将磁珠的存储液漩涡震荡至底部没有沉淀后,吸取合适量的磁珠加入到含有1ml1x TBST1.5mlEP管中。4˚C下上下颠倒5min后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。

细胞规格

10cm

6cm

磁柱用量

2l

8µl


a)                      珠在静置一段时间后会沉积在底部,一定要先混匀后再吸。

b)                      磁力架不能使用2ml管,效果会变差。

2.       加入500µl裂解液后在4˚C下上下颠倒10-15min后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。

a)                      这一步的目的是将磁珠上的一些已经非特异性吸附的杂质洗脱。

3.       100µl的裂解液重悬磁珠,并加入到已除去细胞碎片的细胞裂解液中,在4˚C下上下颠倒摇晃孵育过夜。

4.       在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。加入500µl1x TBST1.5mlEP管中,在4˚C下上下颠倒摇晃清洗5min

5.       重复4步骤2次。

6.       用离心机离心的方法将管盖的溶液甩至管底后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。加入50µl1x TBST以及10µl6x loading buffer,漩涡震荡样品。95˚C(或100˚C)金属浴5min

7.       其后步骤同Western Blot


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