Western blot及CoIP实验步骤
步骤:
(一)提蛋白
1. 弃细胞培养基,用1x PBS(建议经过过滤)清洗两次;
2. 将细胞培养皿放在冰上,加入含有抑制剂的裂解液(RIPA Buffer),4˚C冰箱中裂解20min~30min。
细胞皿规格 | 6well | 60mm | 100mm |
裂解液用量 | 120µl | 300µl | 800µl |
3. 收集裂解液在一个新的1.5ml EP管中,在4˚C下以15000rpm离心15min~30min;
(二)WB
4. 取出适量的蛋白样品(上清),加入loading buffer(将6x的loading配比成1x,即5体积的蛋白裂解液+1体积的6x loading buffer),95˚C(或100˚C)金属浴5min。
a) 上清收集离心后,可直接冻存在-20˚。等到要上样的时候,加入loading buffer。进行蛋白变性。
b) 6x loading buffer从冰箱中取出后需要先进行预热至液体不再黏稠(可以在金属浴旋转放置20sec)。
5. 金属浴结束后,样本短暂置于冰上冷却后。用小型离心机离心,将液体管壁上的液体集中在管底;
6. 用1x running buffer进行电泳(一个孔最大上样量是20µl);
预制胶类型 | 10%浓缩胶 (金斯瑞) | 4%~20%梯度胶(金斯瑞) | 4%~20%梯度胶(美伦) | 4%~20%梯度胶(美伦) |
电压 | 140V | 190V | 170V | 110V |
时间 | 1h | 40min | 30min | 65min |
a) 金斯瑞的预制胶底部有封条,需要使用前撕开。美伦的胶需要先在室温静置5~10min。拔梳子要在液体环境下均匀用力缓慢拔出,确保没有胶残留在孔里面;
b) 电泳电压不宜过快,如若过快会导致蛋白样本模糊以及有拖带;
c) 上样量不能过多,否则蛋白条带会不够锐利。(推荐量10µl);
d) 上样时尽量将样品在加在电泳胶的正中间,空白孔使用等量的1xloading填上;
e) 确保样品之间的盐浓度是平衡的,确保蛋白泳道不会歪。
7. 转膜(湿转)
黑胶白膜:注意不要有气泡,用转膜液,110v,100min,置于冰上。黑板对黑面,白板对红面。
a) 在转膜液中安装好三明治(黑板-黑网-滤纸-胶-膜-滤纸-黑网-白板),这样可以排除气泡。
b) 湿转的电泳槽埋在冰下以后,加入约1/4的脸盆的水。确保电泳槽被冰水混合物接触。
c) 装膜前可选操作是:将蛋白胶在转膜液浸泡5~10min洗去电泳液。
d) 转膜液可回收,但必须经过过滤,除去液体中的固态残留物。避免影响下次实验。
8. 封闭:用含有5%的牛奶或者2~5%的BSA in 1x TBST中封闭,室温摇床1h~1.5h;
a) 部分抗体对封闭的液体是有要求的。注意先看抗体说明书。如果是磷酸化Tyr的抗体绝对不能使用脱脂牛奶封闭。
b) 封闭液中含有蛋白,所以现配现用。
c) 在荧光蛋白质印迹实验中,Tris 盐缓冲液 (TBS) 用作封闭缓冲液稀释剂。封闭缓冲液中不得有 Tween 20® 去垢剂,因为它能自发荧光并增加非特异性背景。封闭步骤后,随后的稀释剂缓冲液再添加 Tween20® 。化学发光蛋白质印迹实验在封闭期间无需省去 Tween 20®。
d) 封闭结束可以用1XTBST清洗有粘性的牛奶封闭液
9. 一抗孵育:4˚C下摇床过夜孵育,或在室温下摇床孵育2小时;
a) 部分抗体含有HRP的基团可以直接省略后续的步骤10和11。
10. 清洗1:室温下用1x TBST清洗三次,每次5min;
11. 二抗孵育:在室温下摇床孵育2小时;
12. 清洗2:室温下用1x TBST清洗三次,每次5min;
13. 显影:显影液1:1配制,(室温避光放置5h没问题)
溶液配制:
1. NaCl (MW: 58.44)
4M 50ml 11.688g
2. Tris [tris base] (MW: 121.14)
1M 50ml 6.057g
3. NP40裂解液:
Tris 50mM
NaCl 200mM
NP40 1%
4. 裂解液(现配现用):
RIPA或者np-40(store):1ml
磷酸酶抑制剂A:10ul
磷酸酶抑制剂B:10ul
蛋白酶抑制剂P:10ul
5. 1x电泳液(现配现用,美伦有自己的10x buffer,一次电泳大约需要800ml):
金斯瑞:为配制好的粉末融于1L的蒸馏水中
美伦生物:使用10x的液体,稀释到1L的蒸馏水中
6. 10x转膜液配方(常温保存):
Tris :30.3g
甘氨酸 :151.1g
蒸馏水 :up to 1L
7. 1x 转膜液(可重复使用,4度保存,必须每次过滤,溶液变绿后丢弃):
10x转膜液 | 100ml | 20ml |
甲醇 | 200ml | 40ml |
ddH2O | Up to 1L | Up to 200ml |
8. 10x TBS:
终浓度 | MW | ||
Tris Base | 24.2g | 200mM | 121.14 |
NaCl | 80g | 1.37M | 58.44 |
ddH2O | Up to 1L | pH=7.6 |
注意:可能需要15ml的浓盐酸调节pH值。浓盐酸1:3稀释在dH2O中,注意浓盐酸稀释会释放大量的热量,且对乳胶手套有一定的腐蚀性。在通风橱中小心操作。
9. 1x TBST:
10x TBS | 100ml |
Tween-20 | 1ml |
ddH2O | Up to 1L |
10. 抗体配制:
配制一抗,1:1000,可以回收利用,保存于-20冰箱。(一抗有专门的一抗稀释液,也可以用含有5% BSA或5%牛奶的TBST稀释,也可以TBST 直接稀释)
二抗配制为1:2000,可以回收利用,保存在-20°。(可以用含有5% BSA或5%牛奶的TBST稀释,也可以TBST 直接稀释)
磁珠富集蛋白(适用于CO-IP)
1. 将磁珠的存储液漩涡震荡至底部没有沉淀后,吸取合适量的磁珠加入到含有1ml的1x TBST的1.5ml的EP管中。4˚C下上下颠倒5min后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。
细胞皿规格 | 10cm | 6cm |
磁柱用量 | 20µl | 8µl |
a) 磁珠在静置一段时间后会沉积在底部,一定要先混匀后再吸。
b) 磁力架不能使用2ml管,效果会变差。
2. 加入500µl裂解液后在4˚C下上下颠倒10-15min后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。
a) 这一步的目的是将磁珠上的的一些已经非特异性吸附的杂质洗脱。
3. 用100µl的裂解液重悬磁珠,并加入到已除去细胞碎片的细胞裂解液中,在4˚C下上下颠倒摇晃孵育过夜。
4. 在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。加入500µl的1x TBST到1.5ml的EP管中,在4˚C下上下颠倒摇晃清洗5min。
5. 重复4步骤2次。
6. 用离心机离心的方法将管盖的溶液甩至管底后,在磁力架上静置1min待磁珠完全被吸附后吸走溶液。加入50µl的1x TBST以及10µl的6x loading buffer,漩涡震荡样品。95˚C(或100˚C)金属浴5min。
7. 其后步骤同Western Blot。